滅菌程序的性能確認是為了證明滅菌工藝始終符合滅菌程序的設計標準，通常由物理確認和生物指示劑確認兩方面組成。物理確認主要測試滅菌過程中的熱分布和熱穿透測試，用以確認被滅菌產品獲得了程序要求的物理殺滅時間FPHY。生物指示劑確認是通過適當的生物指示劑來確認滅菌程序能使整個裝載達到要求的生物殺滅時間FBIO。

      物理和微生物結果之前的一致性是滅菌驗證中最重要的部分。對于蒸汽穿透或熱穿透困難的產品來說，僅僅憑借溫度和壓力測量所得到的物理數據不足以證明滅菌程序達到了規定的接受標準，同樣，單獨的生物指示劑挑戰測試結果合格也不能證明滅菌程序達到要求。 
       熱分布確認目的在于證明整個裝載區加熱介質的分布是均勻的，測試中應使用溫度探頭均勻放置在裝載區域內，但不能與裝載物或滅菌器硬件接觸。
      熱穿透確認目的在于證明裝載物表面達到所需的熱量。對于液體負載測試，熱穿透溫度探頭應置于液體容器中的冷點，或經確定多孔/堅硬物品最難滅菌的位置。
       此外，對于混合裝載模式，探頭應置于每種有代表性的裝載物中。
       生物指示劑確認測試中，常見的生物確認合格標準示例包括：一是孢子的對數下降值符合預期標準；二是規定的陽性和陰性對照符合設定要求。
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