為防止污染物透過圍護結構縫隙侵入潔凈室，潔凈室及潔凈設施的圍護結構應有良好的氣密性，同時和不清潔的周邊環境要維持一定的正壓差。潔凈室的正壓是靠送風 QS 與回風 Qr 和排風 Qe 的差值實現的。

  GB50073《潔凈廠房設計規范》中對潔凈室的壓差控制規定：潔凈室與周圍的空間必須維持一定的壓差，并按生產工藝要求決定維持正壓差或負壓差。不同級別潔凈室以及潔凈區與非潔凈區之間的壓差應不小于 5Pa，潔凈室與室外的壓差應不小于 10Pa。

 潔凈室竣工后，再投入使用之前，首先要經過國家授權的檢測機構的檢測，并且取得潔凈室檢測合格報告，然后徹底消毒以后，才能正常使用。